Deportivo Cali

Trải qua những năm tháng hình thành của Muriel với Atlético Junior, Muriel gia nhập đội bóng Deportivo Cali ở Primera A vào tháng 1 năm 2009.[6][7] Anh có trận ra mắt đội bóng anh gặp Envigado FC vào ngày 12 tháng 7 năm 2009, đây là lần ra sân duy nhất của anh trong năm trước khi ghi 9 bàn sau 10 lần ra sân ở mùa giải tiếp theo. Phong độ ban đầu của Muriel cho Deportivo Cali, bao gồm cú hat-trick vào lưới Once Caldas trong trận đấu thứ ba, khiến anh được biệt danh với cái tên là "Ronaldo Colombia", so với huyền thoại người Brazil Ronaldo. Giữa mùa giải, anh được đội bóng Udinese ở Serie Ý ký hợp đồng.[8][9][10]

Udinese

Ngày 30 tháng 5 năm 2010, đội bóng Udinese ở Serie A chính thức hoàn tất về việc ký hợp đồng đối với Muriel có giá trị 1,5 triệu euro.[11] Về mặt thỏa thuận chuyển nhượng, Udinese có được 70% quyền thi đấu của Muriel và 30% còn lại được Deportivo giữ lại.[12] Tuy nhiên, ngay sau khi đến Udine, anh được Granada ở Segunda División cho mượn.[13]

Cho mượn ở Granada và Lecce

Muriel hoàn tất việc chuyển đến đội bóng Granada ở Tây Ban Nha dưới dạng cho mượn vào ngày 12 tháng 7 năm 2010.[14] Granada đã thăng hạng La Liga lần đầu sau 35 năm nhưng đó là một mùa giải không thành công đối với Muriel, khi anh chỉ ra sân 7 lần trong mùa giải và không ghi được bàn nào.[15][16]

Khi hết hạn cho mượn ở Granada, Muriel lại được Lecce ở Serie A cho mượn trong mùa giải tiếp theo. Anh có trận ra mắt câu lạc bộ vào ngày 27 tháng 10 năm 2011, vào sân ở hiệp hai thay cho Daniele Corvia trong trận thua 0–2 trước Palermo.[17] Trong lần đầu ra sân cho đội bóng anh vào tháng sau, trong trận đấu gặp Cesena, Muriel đã bị đuổi khỏi sân vì kèo thẻ phạt. Tuy nhiên, Lecce vẫn giành chiến thắng 1–0 nhờ bàn thắng của Juan Cuadrado.[18] Anh đã cải thiện để kết thúc mùa giải với 7 bàn thắng sau 29 lần ra sân, mặc dù những nỗ lực của anh vẫn không đủ để ngăn cản đội bóng Lecce xuống hạng ở Serie B.[19] Muriel với phong độ trong suốt mùa giải đã được thu hút sự chú ý của AC Milan và Inter Milan, cả hai câu lạc bộ đều đưa ra lời đề nghị chính thức để ký hợp đồng đối với anh, nhưng Muriel xác nhận rằng anh sẽ trở lại với đội bóng Udinese.[20]

Trở lại Udinese

Tình trạng thể chất tồi tệ của Muriel khi trở lại Udinese khiến HLV Francesco Guidolin nổi giận, với việc huấn luyện viên câu lạc bộ khăng khăng rằng anh chỉ cần giảm tới 2,3 kg, mặc dù Muriel đã ghi bốn bàn vào lưới đối thủ Arta Cedarchis trong trận giao hữu trước mùa giải.[21][22] Anh có thể lấy lại phong độ từ đầu mùa giải và có trận ra mắt trong trận thua 1–2 trước Fiorentina vào ngày 25 tháng 8 năm 2012, với kiến tạo giúp cho Maicosuel ghi bàn mở tỷ số.[23] Anh ký gia hạn thêm hợp đồng vào tháng sau, ký một bản hợp đồng có thời hạn 5 năm cải tiến với đội bóng.[24] Tháng 1 năm 2012, Muriel đã được vinh danh là Cầu thủ trẻ xuất sắc nhất Serie A cùng với Stephan El Shaarawy - AC Milan để ghi nhận phong độ của anh với Lecce và Udinese năm trước.[25] Vào cuối mùa giải, anh đã đóng góp 11 bàn thắng sau 22 lần ra sân ở Serie A, mặc dù phải nghỉ thi đấu gần 4 tháng vì bị chấn thuơng đùi trái.[21][22]

Mùa giải tiếp theo, ở vòng loại trực tiếp UEFA Europa League 2013–14, Muriel ghi bàn thắng đầu tiên ở Europa League, ghi hai bàn trong chiến thắng 3–1 trước Široki Brijeg và trong trận đấu đầu tiên của giải đấu, ghi bàn vào lưới nhà đương kim vô địch Coppa Italia – Lazio trong trận thua 1–2.[26][27] Tuy nhiên, phong độ của Muriel lại sa sút khi anh phải vật lộn với các vấn đề cân nặng và chấn thương, và trong suốt mùa giải rưỡi tiếp theo, anh chỉ ghi được 4 bàn sau 35 lần ra sân ở giải đấu, bao gồm cả một trận không ghi bàn nào sau 11 trận kể từ đầu của mùa giải Serie A 2014–15.[28][29] Cuối cùng, anh đã ghi được 15 bàn thắng sau 57 lần ra sân cho Udinese, trước khi rời đội bóng anh để gia nhập đội bóng Sampdoria năm 2015.[30]

Sampdoria

Bất chấp những khó khăn của Muriel với Udinese, Sampdoria đã hoàn tất bản hợp đồng cho mượn đối với anh cùng đồng đội - Andrea Coda vào ngày 22 tháng 1 năm 2015, với thương vụ chiêu mộ cả hai cầu thủ này vào cuối mùa giải có giá trị tổng số tiền là 12 triệu euro. Về mặt thỏa thuận này, Muriel ký hợp đồng với Sampdoria có thời hạn đến ngày 30 tháng 6 năm 2019.[31][32][33] Anh đã ghi 4 bàn sau 16 lần ra sân trong thời gian cho mượn trước khi hoàn tất với vụ chuyển nhượng vĩnh viễn vào cuối mùa giải.[31] Muriel đã ghi được thành tích trở lại tốt nhất trong sự nghiệp câu lạc bộ với 11 bàn thắng và 5 pha kiến tạo ở giải đấu, khiến Sevilla phá kỷ lục Sampdoria để ký hợp đồng đối với anh vào cuối mùa giải.[34]

Sevilla

Ngày 11 tháng 7 năm 2017, đội bóng Sevilla ở La Liga - Tây Ban Nha đã thông báo về việc ký hợp đồng đối với Muriel với mức giá kỷ lục của câu lạc bộ là 20 triệu euro cùng với các điều khoản bổ sung tiềm năng.[35][36] Anh có trận ra mắt Sevilla vào ngày 19 tháng 8, trong trận hòa 1–1 trước Espanyol và ghi bàn thắng đầu tiên cho câu lạc bộ vào ngày 17 tháng 9, ghi bàn ấn định chiến thắng 1–0 trước Girona.[37][38] Sau một thời gian ra mắt đáng thất vọng, trong đó có Muriel chỉ ghi được 9 bàn thắng sau 46 lần ra sân, Muriel xếp đứng thứ tư chỉ sau Wissam Ben Yedder, André Silva và Quincy Promes ở mùa giải tiếp theo.[39]

Cho mượn ở Fiorentina

Ngày 2 tháng 1 năm 2019, Muriel trở lại Serie A sau khi ký hợp đồng với Fiorentina dưới dạng cho mượn trong phần còn lại của mùa giải.[40] Anh đã lập một hat-trick trong trận ra mắt không chính thức một tuần sau trong chiến thắng trước Hibernians của Malta trước khi ra mắt chính thức vào ngày 14 tháng 1, trong chiến thắng 2–0 trước Torino ở Coppa Italia.[41][42] Sau đó, anh ghi hai bàn trong trận ra mắt ở giải đấu vào ngày 20 tháng 1, trong trận hòa 3–3 trước đội bóng cũ – Sampdoria.[43] Cuối cùng, anh có 6 bàn thắng ở giải đấu trong thời gian cho mượn nhưng Fiorentina không được mua đứt sau khi câu lạc bộ đã thay đổi quyền sở hữu.[44][45]

Atalanta

Ngày 21 tháng 6 năm 2019, sau thời gian cho mượn thành công ở đội bóng Fiorentina, Muriel trở lại Serie A sau khi ký hợp đồng vĩnh viễn với câu lạc bộ Atalanta với bản hợp đồng mua đứt có giá trị 18 triệu euro.[46]